Prvi jednostavni CAPTCHA sistemi razvijeni su 1995. godine na Sveučilištu u Hong Kongu. Sistem se koristio za zaštitu anketa od automatskih programa (engl. bot) koji su se predstavljali kao ljudski korisnici. Razvijeni sistem je stvarao i korisnicima prikazivao sliku šesterocifrenog broja, te su korisnici trebali raspoznati i upisati prikazani broj kako bi im se omogućilo glasanje na anketi. Nakon toga, 1997. godine u tvrtci Altavista razvijeni su jednostavni CAPTCHA sistemi s ciljem sprječavanja automatskog dodavanja URL-ova u bazu podataka web pretraživača. Razvijeni CAPTCHA sistem stvarao je slike otporne na algoritme raspoznavanja teksta primjenom dokumentacije algoritama u kojima je opisano koje promjene nad tekstom čine algoritam neučinkovitim.
Automatsko razlikovanje računara i ljudi prvi puta se spominje 1996. godine u znanstvenom članku "Verifikacija čovjeka u sistemu, odnosno identifikacija primjenom Turingovog testa" (engl. Verification of a human in the loop, or Identification via the Turing Test) autorice Moni Naor. CAPTCHA sistemi prvi puta su formalno definisali 2000. godine. Istraživači Luis von Ahn, Manuel Blum, Nicholas Hopper, i John Langford sa sveučilišta Carnegie Mellonu znanstvenom članku "CAPTCHA: Primjena teških problema iz područja umjetne inteligencije u zaštiti računarskih sistema" (engl. CAPTCHA: Using Hard AI Problems for Security). Osim toga, navedeni istraživači razvili su i CAPTCHA sistem za kompaniju Yahoo. Od tada su razvijeni brojni različiti CAPTCHA sistemi te su se počeli primjenjivati u raznim područjima računarstva.
Danas oko 200 milijuna ljudi širom svijeta svaki dan rješava CAPTCHA-u. U svakom slučaju, otprilike deset sekundi ljudskog vremena se troši. Pojedinačno, to nije puno vremena, ali ukupno to je više od 150.000 sati svaki dan.